Friday, February 17, 2017

How to get the PDF? Access to the full-text of the e-journal collection of the University of Groningen and the CMB : ALL OPTIONS

(click here for the Dutch versions)
Do you want to know ALL OPTIONS to get access to the pdf of an scientific article? You will find all tips and tools below.

The University of Groningen Library has -together with the Central Medical Library UMCG- a very large collection e-journals (e-journals; 50.000+ titels)
The search-engine/catalogue SmartCat, but also the Get it!-button are two main ways to reach the full-text, but both tools do have their issues. Only too often things go wrong in offering our users the direct access to the pdf's. (more details on this at the end of the post)
  • We often can not explain this to the customer.
    It causes frustration and confusion. Many users stop using these tools or disconnect from the library alltogether ...

    This is really unnecessary, with the use of these tips and tools!

Here is the overview of ALL options to get your PDF!:

1. Via the Get it!-button, presented in almost all our scientific bibliographic databases, like Pubmed (but also WoS, Scopus etc.)Please use always the Pubmed link used  on the CMB-website.
(Advice: replace your current Favorites link to PubMed with this one: )Where ever you are online in the world, you will then always be presented the Get-it!-button on the article-level in Pubmed!
It is though unfortunately, not a 100% guarantee that you you will get access to the PDF:
    • The best advice we can give you currently is to use the DOI-link (Digital Object Identifyer) presented in each PubMed-record (see the image below) It is shown next to the PUBMED-ID near the bottom of the record. It will take you directly to the publishers/journal-site
      If you can download the PDF there, it is because the library has a subscription (or it's free or Open Access).
      If you can not download the PDF from there, we do not have a current subscription for access to the full-text.

    • Allthough we do have a very large e-journal collection, we do not have everything in subscription!
      The Get it!-button shows if we do or don't have access to the full-text. If we do, you are presented with a link directly to it, but ....
      CURRENTLY THERE IS AN ISSUE WITH THE GET IT!-button in PUBMED. It presents -in some cases- incorrectly the message that we do not have access. we are working very hard to repair/improve this. Please contact us, if you notice something is wrong (
    • Please note that also in the case pre-prints and "early online" versions of articles the Get it!-button might give this incorrect message, due to the fact that it is simply too new, and even the publishers have not integrated the complete metadata themselves. Please try the DOI-link or the Publishers-link in these cases too!

Other options to get the PDF below!

2. Using the Eduroam wifi inside the UMCG, will get you access to the PDF without having to use the library proxy-login! 

If -for some reason- you do NOT get access to the PDF while using Eduroam:
a. either we do not have a subscription (and it it is not free or Open Access) ÓR
b.  there is something wrong with the subscription and the online access. This can involve issues with payment, changes, take-over, bankruptcy, errors, mistakes or internet issues.
On a collection size of 50.000 online journals, there is always a small amount of ongoing issues. 
Please contact us, if you notice something is wrong (

3. If you are using links to publishers of journals NOT generated from our library website (CMB-website) and you are NOT using Eduroam in het UMCG:

a. the Get it!-button will NOT appear ->

b. Start using our CONNECT-tool for this! This is a button you can easily add to your browser, simular to a favorite-link in your Bookmark- or favourite-bar. This works for a laptop or desktop, but you can also install this on your tablet or smartphone!
No matter where you are online, this button will take you from the so-called PAYWALL (where they ask you to buy the article for a lot of money), directly to the PDF, with a push of the button (via the library proxy-login)
Our advice is to: save your login-details of the proxy in your browser!
Details on how to install the CONNECT-button are here and a short instruction-video.

c. Extra feature of the CONNECT-button: it makes the Get it!-button appear again in Pubmed for you, if you just started at, instead of using the CMB PubMed-link ;-)

4. Extra tools and options to get to the PDF
a. The Google Scholar-button: simular to the CONNECT-button, but also searches for all possible other available pdf's out there f the same publication
for CHROME | Firefox (i did not find this for different browsers like IE or Safari)

b. Use services like DOAI en oaDOI: you can enter the digital object identifier (DOI) and the service will search free-accessible versions of the publications. DOAI and oaDOI search preprint archives, ResearchGate and/or institutional repositories (like our own Pure research database)
c. For twitter  users: use the hashtag #icanhazpdf together with a link to the requested publication; if somebody has access, they can send you the PDF.

d. Request a copy at your library; this is not free, but often a fast option, and much cheaper than buying it from the publisher. We have special rates for staff, phd;s and students!
e. you can of course BUY it from the Publisher or Journal itself anyway...
f. request a copy from the AUTHOR directly: often not the fastest way, but traditionally a well-used route to get pdf's ...

g. use our journal app BROWZINE (als web-access )
By registering as University of Groningen/UMCG staff ánd the use of the library proxy-login, you can get a personalised way of access to all Tables of Content you wish for, ánd direct access to the PDFs of ALL our e-journals. Browzine offers óne interface for all journals, with a lot of extra features that make keeping up to date a lot easier!
 “What you see, is what you get” + “You don’t see, what we don’t have”

h. Use the journal app READ by QXMD (also as web-access:
By registering as Universitair Medisch Centrum Groningen staff members, 
ánd the use of the library proxy-login, you can get a personalised way of access to the latest medical publications, get alerts on new content relevant for you, ánd of course, direct access to the PDFs. Annotations options for pdf is a very neat feature of READ, including the search & topic alert.  
The CMB now has an institutional license for READ by QXMD. You will be able to SEE our holdings, adn get the PDF even quicker now. (more information soon!)

i. And last, but not least -to not forget the "elephant in the room"
- : 
If all else fails, you have the option to consider using Sci-Hub. It is estimated that it contains currently about 50% of all publications, so you got a pretty good chance to get what you need. There is however a big BUT! There is a RISK in using this "service". In many countries the use of Sci-Hub is considered as an "illegal act", as if involves content protected by copyright laws.
There are ongoing lawsuites of Elsevier against Sci-Hub.
As a library, we can not advice the use of Sci-Hub, but research shows the use is worldwide ánd substantial. Use at your own risk.


Background information on Smartcat and the Get It!-button
  • In SmartCat people get often "lost in multiple presentations of print- and e-content editions. Often the emphasis is on the printed materials, rather than the e-content.
  • The Get it!-button does not always show the correct access information on online full-text access, while the publishers icon in PubMed DOES take the users to the PDF.  Also "ahead-of-print" publications can often not resolveded to the PDF via the Get it!-button. Not only the OCLC linkresolver has this issue, also the others have this issue.

Hoe krijg ik de pdf? :Toegang tot de full-text van e-journal collectie CMB en UB, alle opties

(click here for the english version)

Wil je weten op welke manieren je makkelijker toegang kunt krijgen tot de pdf van een e-journal dat je zoekt? Hieronder schets ik alle mogelijkheden.

De Universiteitsbibliotheek Groningen heeft -samen met o.a. de Centrale Medische Bibliotheek (CMB UMCG)- een enorme collectie electronische tijdschriften (e-journals; zo'n 50.000 titels)
De zoekmachine/catalogus SmartCat maar ook de Get-it-knop zijn twee manieren om bij de full-text te komen, maar met beide tools gaat er nogal eens wat mis. (Lees meer details hierover aan het eind)
  • Dit is niet uit te leggen. Het zorgt voor veel onvrede, en mensen die afhaken bij het gebruik van die tools of de bibliotheek...
    Dit is NIET nodig, met een aantal tips en trucs!

Hier zijn alle manieren om toegang tot de full-text te krijgen:

1. Via de Get-it knop in onze literatuur databases (zoals Pubmed, WoS, Scopus e.d.)Als je de Pubmed link van de CMB website gebruikt (advies: vervang je huidige link naar Pubmed in Favorieten met deze link )Waar je ook ben met je Internet toegang, je krijgt dan bij elk artikel ALTIJD de Get-it-knop erbij.
Dit is echter geen 100% garantie dat je ook daadwerkelijk de full-text krijgt:

    • Het beste ADVIES is momenteel om in datzelfde Pubmed record op de DOI link te klikken, te vinden onderaan, naast het PMID-nummer. Je komt dan terecht bij de uitgevers/tijdschrift site.
      Als je daar de pdf kunt downloaden, hebben we een abo (of het is gratis/OA). Als het je ook daar niet lukt, hebben wij geen toegang op basis van onze abonnementen. Klik in dat geval ook op de DOI Link van het Pubmed-record óf op de link van de uitgever/tijdschrift.

    • Alhoewel we heel goede collectie hebben, we hebben niet alles.
      De Get-it knop laat zien OF we een abo hebben met full-text toegang. Zo ja, krijg je een link daarnaar toe, maar .. 
      Er is momenteel een issue met de werking van de Get-it-knop in Pubmed, waardoor er soms onterecht een melding komt dat we GEEN toegang zouden hebben. We zoeken dit zsm uit.
    • Het is bekend dat de Get-it knop moeilijkheden heeft met pre-prints en "early online" versies, omdat simpelweg de uitgevers zelf hun data ook nog niet op orde hebben

Mogelijke andere manieren om aan de pdf te komen hieronder!

2. Als je in UMCG de Eduroam wifi gebruikt, krijg je altijd direct de pdf-versie te zien. Het is dan niet nodig om eerst in de proxy in te loggen.

Als je ondanks de Eduroam wifi, toch géén toegang krijgt tot de pdf-versie:
a. Dan hebben we geen abo, is het niet gratis of OA
b. Óf er is iets mis met het abonnement en de online toegang. Dit kan te maken hebben met de betaling, wijzigingen deals, foutjes, Internet issues.
Op een bestand van 50.000 online tijdschriften, is er altijd een heel klein deel waar “iets mis mee is”. In dat geval, als men het niet zeker weet, kan men het beste even contact opnemen met de

3. Als je NIET via de CMB-website of –links naar uitgevers of tijdschriften surft, en NIET via Eduroam in het UMCG, dan:

a. Verschijnt de Get-it knop NIET

b. Gebruik dan onze CONNECT-tool. Dit is een knop die je aan je Internet-browser kunt toevoegen, op een laptop, desktop, maar ook op je tablet.
Krijg je bij een tijdschrift NIET de pdf te zien, maar de zogenaamde PAY-WALL, een druk op de CONNECT-knop zorgt ervoor dat je, middels een inlog-pop-up direct in de Proxy kunt inloggen
(advies: sla de login in proxy op in je browser!) Na het invullen van je proxy-details, gaat men dan direct door van de PAY-WALL naar de PDF-versie!
Details over de installatie van de CONNECT-knop vind je hier en een kort filmpje over de CONNECT-knop.

c. (Bijkomend voordeel is dat de CONNECT-knop, óók het Get-it-icoontje laat verschijnen in

4. Extra tools en/of manieren om (mogelijk) aan de pdf te komen
a. De Google Scholar-knop: vergelijkbaar met de CONNECT-knop, maar zoekt ook naar mogelijk andere full-tekst versies van hetzelfde artikel
voor CHROME | Firefox (niet gevonden voor andere browsers als IE of Safari)

b. Diensten als DOAI en oaDOI: Je kunt de digital object identifier (DOI) invullen en de dienst zoekt of er vrij-toegankelijke versies beschikbaar zijn van het artikel. DOAI en oaDOI doorzoeken preprint archives, researchgate en/of institutional repositories (zoals onze Pure)
c. Voor twitter-gebruikers: #icanhazpdf Gebruik deze hashtag, samen met een link naar het gewenste artikel; als iemand toegang heeft, kunnen ze het artikel toesturen.

d. Aanvragen bij de bibliotheek; niet gratis, maar een vaak snelle oplossing en veel goedkoper dan via de uitgever/tijdschrift. Speciale tarieven voor studenten en phd’s.
e. Toch maar betalen op de uitgevers site …
f. Aanvragen bij de auteur: vaak niet de meest snelle oplossing, maar van oudsher een veel gebruikte route

g. Gebruik onze journal app BROWZINE (nu ook als website ) Door te registreren als University of Groningen/UMCG medewerker, en het gebruik van de proxy-login in de app, krijgt men altijd direct de pdf’s van al onze online tijdschriften. Alle tijdschriften van de hele Universiteit in één interface (Table of Contents), met personalisatie-opties met behulp van persoonlijke “boekenkastjes”.
“What you see, is what you get” + “You don’t see, what we don’t have”

h. Gebruik de journal app READ by QXMD (ook als website Door te registreren als Universitair Medisch Centrum Groningen, en het gebruik van de proxy-login in de app, krijgt men altijd direct de pdf’s van al onze online tijdschriften.
Bevat alleen medische tijdschriften, maar laat ook online-first artikelen direct zien, in een meer visuele presentatie, met personalisatie-opties.
Als we een abonnement hebben krijgt, men direct toegang tot pdf. Bevat ook titels die we niet hebben. De CMB heeft nu een institutionele licentie voor Read by QXMD voor het UMCG. (méér info volgt spoedig!)

i. En als laatste optie natuurlijk ook –om “the elephant in the room” niet te vergeten, Sci-Hub
Als niks lukt, is er ook nog steeds de mogelijkheid van het verkrijgen van het artikel uit Sci-Hub. Het heeft betrekking op ongeveer 50% van alle artikelen, dus er is een vrij goede kans dat je krijgt wat je nodig hebt daar. Er kleeft wel een groot bezwaar aan het gebruik van Sci-Hub. In veel landen Sci-Hub wordt beschouwd als illegaal omdat het gaat om het downloaden van auteursrechtelijk beschermde inhoud. Er loopt al een gerechtelijke procedure van Elsevier tegen Sci-Hub. Als bibliotheek kunnen we het gebruik van Sci-Hub niet adviseren, maar onderzoek wijst uit dat het gebruik wereldwijd is en substantieel. Gebruik is geheel op eigen risico.


Achtergrond informatie Smartcat & Get It!-button
  • In SmartCat "verdwalen" mensen in een wirwar van presentatie van edities, links en versies. Bovendien ligt er vaak de nadruk op het "gedrukte" materiaal.
  • de Get-it-Knop toont soms niet de juiste informatie over online toegankelijkheid, terwijl de uitgevers-knop, bijv. in Pubmed dan wél de pdf oplevert. Ook bij "ahead-of-print" artikelen, kan de Get-it-Knop vaak niet direct doorlinken naar de full-text. (Dit geldt overigens voor meer linkresolvers)
    Dit is niet uit te leggen. Het zorgt voor veel onvrede, en mensen die afhaken bij het gebruik van die tools of de bibliotheek...

Friday, November 18, 2016

Altmetrics seminar shows where research evaluation will (need to) go in the future

I found the talk by Paul Wouters on responsible metrics for Open Science extremely interesting and thought provoking. A very good break-down of key-factors and elements that play a role.
I hope the recorded streams will be online soon!
Conclusions & take home messages for me:

  • I need to dive deeper in theory & sociological approach of research evaluation
  • I plan to read up on the papers mentioned & showed in Paul's talk.
  • uses impressive techniques (i.e. text-mining) to find references to scientific publications. Those slides are a MUST-SEE! Ben McLeish did a great job explaining what they do & how far they have come already.
  • Where shows all the attention outside the organisation connected to scientific publications, PlumX has a more focus on showing how people inside the organisation doing, including comparing them.
  • Kudos expects individual researchers to boost their own research in laymens term, giving them tools to promote, and measure the effect afterwards
  • It is annoying and confusing that all  parties have many simular sources for altmetrics data, but also unique resources not shared with others. In my opinion they NEED to collabarate even more in the future to complement into better altmetrics data for all.
  • Mendeley data seems to be pretty close to citation analysis in showing what are going to be higly cited publications!
  • As to our project in the UMCG: time to more forward.
    We now have a very neat dashboard which monitors all mentions of our researchers on the web & social media. The library will start the discussion about how to use it, and how to evaluate research output in the future.
    If people want to know more about our project, please contact me!


Wednesday, August 10, 2016

What tools do Dutch researchers in the discipline Medicine use? Question 1 SEARCH

I recently got a question about the results of the UMCG in the survey 101 Innovations in scholarly communications. Truth is, I have not looked into it yet. It only involved 273 participants.
In my opinions too little to draw general conclusions, but if we could zoom out to a Dutch level .....

There are 645 responses who stated they are currently in the Netherlands (or their last affiliation was) Here is a drill-down:
645 is is not an impressive amount. If we add discipline Life Sciences, we get to 765.
On the European level we reach the total amount of 2200 responses.
Two questions arise:

  • Can we draw any conclusions on the Dutch result based on just 765 responses? And
  • Do the Dutch results differ from the overall European outcome?
The survey has 17 questions. Let's look at them one by one with the above questions in mind.
  1. What tools/sites do you use to search literature / data / etc.?
Search literature / data / etc  (PRESET ANSWERS): DUTCH
Search literature / data / etc  (PRESET ANSWERS): EUROPE

Search literature / data / etc (OTHERS) DUTCH

Search literature / data / etc (OTHERS) EUROPE
A 3rd question could be: Do the Dutch results differ substantially from the WORLDWIDE results in the discipline MEDICINE?
Unfortunately the SILK for the original is having performance issues currently. Let's hope Jeroen or Bianca or Silk can solve that soon.

Friday, June 17, 2016

Digicmb Back at Blogspot : missing visualizations and embeds

I am picking up where I left with Blogspot after a long sidestep  to Rebelmouse.
Rebelmouse is a very powerful tool aggregation & curation of information, for blogging, a website even, but I miss the possibility to simply EMBED some widget, some html-code to tweak a post of info in a post........
In particular was i looking for a place to show results from the big survey 101 innovations in scholarly communication on certain topics in general, but with focus on a special SILK Dashboard on European researchers population that responded within the discipline MEDICINE.

Here are two examples:

Thursday, April 03, 2014

Adding Bookmarklets to your iPad / iPhone browser; i.e. Library Proxy

Bookmarklets can be very useful. To install these in "normal" browsers is rather simple. They appear as a Bookmark in your Bookmark bar and can be activated by single click when needed.
Here is the page about installing the RUG proxy bookmarklet in your desktop/laptop browser.
This proxy bookmarklet will check from any webpage if you have access to the fulltext of the journal, article or other digital library licenced resource!

On the iPad it is a bit more complicated, but not difficult.
(If you do not see you Bookmark Bar on your iPad, go to Settings, Safari; Turn ON "Always Show Bookmarks Bar")
Here the description on how to install the RUG proxy bookmarklet in the iPad browser.

Step 0: Open this post on your ipad ....
Step 1: Use "Add Bookmark" (it does not matter from what page) to create a bookmark and ..
Step 2: Call it : Library Proxy, and click"SAVE"
Step 3: Open Bookmarks & History (click the open book ...)
Step 4: Go to the Bookmarks Bar, and click "EDIT" (upper-right corner)
Step 5: Click the "Library Proxy"bookmark. Edit Bookmark window will open
Step 6: Now copy one of the javascripts from below, and simply paste it inside the line BELOW the title of the bookmark. This is normally the url, but this time we will PASTE this little javascript in it.
Step 7 No need to save! Just click anywhere outside the pop-up, the window will close and the Bookmarklet is installed!


You can now test the bookmarklet to get access to the latest UMCG publications "atUMCG"
Click on a title. The article will , most of the time, open in PubMed.
Now click the Library Proxy Bookmarklet. It will ask you to login once with your proxy account (or with your P- or S-account)
You will not see the normal RUG GetIT! icon, but you can just click the "Fulltext" link, either on the Publishers icon, or in the LinkOut, More resources.
Even if you at first not get the fulltext, you can activate the Library Proxy to go to the right page WITH the fulltext.
IF we do not have licenced access, tyou will not get it, no matter how often you click the Library Proxy Bookmarklet ;-)
IF you by chance get a page telling you the access can only by from WITHIN RUG or UMCG domain, please follow instructions, and hopefully the acccess via proxy will be arranged asap.

Thanks to Chris Bray:
Here is his list of Bookmarklets to use for the iPad/iPhone:

Share on Posterous
Shorten with
Add to Google Reader
Bookmark on
Instapaper: Read Later
Share on Facebook
Clip to Evernote
Share on Tumblr
Translate to English
Digg This
Stumble Upon
Site Info
Show Images
Validate HTML

Next in line to create:

  • RefGrab-it Bookmarklet for Ipad

  • Put these bookmarklets on Feedflare units to INCLUDE them in the posts, instead of in the Bookmark bar.